校徽为圆形图案，校徽上部自左而右环绕中文校名标准全称，下部自左而右环绕英文校名标准全称，中间为海棠式洞窗图案。洞窗图案以国立广东大学的标志性建筑“大钟楼”为设计主体，运用中国园林的意境与现代的设计手法，借用园林中的海棠式洞窗与大钟楼外观组合成“中山”二字，洞窗内两边的树由大到小形成一个深远的空间，增强了层次感和立体感，中间的弧形巧妙形成一朵红棉花，是岭南地区标志性树种，意寓中山大学扎根于岭南地区。由建校年份“1924”形成的一条纵深大道，体现了中山大学深厚的学术积淀和辉煌的历史进程。

中山大学校徽通常为标准绿色，代表生命、发展、永恒，象征着中山大学充满活泼、盎然的生机。